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Delimitação de espécies em Hymenochaetaceae Donk (Basidiomycota, Fungi) a partir de dados morfológicos e DNA barcoding

Hymenochaetaceae Donk (Basidiomycota, Fungi) caracteriza-se por apresentar basidiomas ressupinados a pileados, reação xantocróica positiva, presença de setas himeniais (na maioria) e de hifas generativas sem grampos de conexão, além de reunir fungos causadoras de podridão branca. A circunscrição dos...

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Main Author: LIMA JÚNIOR, Nelson Correia de
Other Authors: MAIA, Leonor Costa
Format: doctoralThesis
Language: por
Published: Universidade Federal de Pernambuco 2018
Subjects:
Basidiomycota
DNA
Filogenia
Online Access: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/25954
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id ir-123456789-25954
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spelling ir-123456789-259542019-10-26T04:47:30Z Delimitação de espécies em Hymenochaetaceae Donk (Basidiomycota, Fungi) a partir de dados morfológicos e DNA barcoding LIMA JÚNIOR, Nelson Correia de MAIA, Leonor Costa GIBERTONI, Tatiana Baptista http://lattes.cnpq.br/2979583202594058 http://lattes.cnpq.br/6736575837409659 Basidiomycota DNA Filogenia Hymenochaetaceae Donk (Basidiomycota, Fungi) caracteriza-se por apresentar basidiomas ressupinados a pileados, reação xantocróica positiva, presença de setas himeniais (na maioria) e de hifas generativas sem grampos de conexão, além de reunir fungos causadoras de podridão branca. A circunscrição dos gêneros e espécies em Hymenochaetaceae é imprecisa, principalmente no âmbito da taxonomia tradicional, o que torna dúbia a identificação de espécies quando são utilizados exclusivamente dados morfológicos. Nessa perspectiva, estudos baseados em sequências de DNA das regiões ITS e LSU (rDNA) estão sendo responsáveis por significativos progressos na taxonomia do grupo, porém estudos com táxons neotropicais são escassos. No presente estudo foram utilizados espécimes de Hymenochaetaceae coletados em diferentes biomas brasileiros para extração de DNA genômico, amplificação das regiões ITS e LSU por meio de PCR e posterior sequenciamento. Foi observado o delineamento morfológico e/ou molecular de duas espécies de Fomitiporia, duas de Fulvifomes, quatro de Fuscoporia, seis de Hymenochaete, duas de Phellinotus, uma de Phellinus e uma de Tropicoporus. Dentre essas, são propostas: uma nova espécie de Fuscoporia; uma sinonimização em Phellinus, uma em Tropicoporus, uma em Hymenochaete e uma possível sinonimização em Fomitiporia; além da confirmação de combinação Fulvifomes rhytiphloeus a partir de evidências moleculares. São registradas ainda uma nova ocorrência de Fomitiporia e de Hymenochaete para o Brasil. De modo geral, observou-se que as sequências da região ITS e/ou LSU foram úteis no delineamento das espécies em estudo, principalmente em espécies morfologicamente semelhantes e próximas do ponto de vista evolutivo. CNPq Hymenochaetaceae Donk (Basidiomycota, Fungi) is characterized by sessile or pileate basidiomes, positive xanthochroic reaction, occurrence of hymenial setae (frequent) and absence of clamps. Besides, species of this group are also known for producing white rot. The circumscription of genera and species within Hymenochaetaceae is inaccurate, especially under the traditional taxonomy, which makes dubious species identification when used exclusively morphological data. From this perspective, studies based on DNA sequences of the regions ITS and LSU (rDNA) are accounting for significant progress in the taxonomy of the group, but studies with Neotropical taxa are scarce. In this study, Hymenochaetaceae specimens were collected in different Brazilian biomes for DNA extraction, amplification of the regions ITS and LSU by PCR and subsequent sequencing. We observed the morphological and/or molecular delimitation of two species of Fomitiporia, two of Fulvifomes, four of Fuscoporia, seven of Hymenochaete, two of Phellinotus, one of Phellinus and one of Tropicoporus. Among these it is proposed: a new species of Fuscoporia; one synonymization in Phellinus, one in Tropicoporus, one in Hymenochaete and a possible synonymization in Fomitiporia; and a confirmation of the combination in Fulvifomes rhytiphloeus upon molecular data. We also report a new record of Fomitiporia and another of Hymenochaete from Brazil. In general, it was observed that sequences of ITS and/or LSU region are useful for species delimitation, particularly for those which are morphologically similar and evolutionarily close related. 2018-08-28T22:41:07Z 2018-08-28T22:41:07Z 2016-02-25 doctoralThesis https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/25954 por openAccess Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ application/pdf Universidade Federal de Pernambuco UFPE Brasil Programa de Pos Graduacao em Ciencias Biologicas
institution REPOSITORIO UFPE
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Filogenia
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LIMA JÚNIOR, Nelson Correia de
Delimitação de espécies em Hymenochaetaceae Donk (Basidiomycota, Fungi) a partir de dados morfológicos e DNA barcoding
description Hymenochaetaceae Donk (Basidiomycota, Fungi) caracteriza-se por apresentar basidiomas ressupinados a pileados, reação xantocróica positiva, presença de setas himeniais (na maioria) e de hifas generativas sem grampos de conexão, além de reunir fungos causadoras de podridão branca. A circunscrição dos gêneros e espécies em Hymenochaetaceae é imprecisa, principalmente no âmbito da taxonomia tradicional, o que torna dúbia a identificação de espécies quando são utilizados exclusivamente dados morfológicos. Nessa perspectiva, estudos baseados em sequências de DNA das regiões ITS e LSU (rDNA) estão sendo responsáveis por significativos progressos na taxonomia do grupo, porém estudos com táxons neotropicais são escassos. No presente estudo foram utilizados espécimes de Hymenochaetaceae coletados em diferentes biomas brasileiros para extração de DNA genômico, amplificação das regiões ITS e LSU por meio de PCR e posterior sequenciamento. Foi observado o delineamento morfológico e/ou molecular de duas espécies de Fomitiporia, duas de Fulvifomes, quatro de Fuscoporia, seis de Hymenochaete, duas de Phellinotus, uma de Phellinus e uma de Tropicoporus. Dentre essas, são propostas: uma nova espécie de Fuscoporia; uma sinonimização em Phellinus, uma em Tropicoporus, uma em Hymenochaete e uma possível sinonimização em Fomitiporia; além da confirmação de combinação Fulvifomes rhytiphloeus a partir de evidências moleculares. São registradas ainda uma nova ocorrência de Fomitiporia e de Hymenochaete para o Brasil. De modo geral, observou-se que as sequências da região ITS e/ou LSU foram úteis no delineamento das espécies em estudo, principalmente em espécies morfologicamente semelhantes e próximas do ponto de vista evolutivo.
author2 MAIA, Leonor Costa
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